术语解读:PPI:蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction)PPImoduleI:指蛋白质相互作用模块,一个模块指向一个功能数据要求:基因列表应用示例1:(于2018年3月发表在Immunity.,影响因子)T细胞活化过程中产生蛋白质组进行多重定量分析,然后对差异表达蛋白权重聚类,并将聚类蛋白叠加到PPI网络上以识别功能模块。D.模块大小的分布,通过将每个WPC(权重聚类结果)中的蛋白叠加到蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络上识别模块。每个模块的蛋白质数量显示出来。E.各个模块及其交互的关系图。圆圈(节点)表示90个模块,圆圈大小与模块大小成比例。...
genomeview(基因浏览图):genomeView是对基因组的可视化,可以直观展示RNA-seq和ChIP-seq的信号,证实转录因子结合对基因转录的影响等等。 数据要求:RNA-seq和ChIP-seq等数据。应用示例:文献1:Genomic landscape and evolution of metastatic chromophobe renal cell carcinoma.(于2017年6月发表在JCI Insight.,影响因子6.041)。本文对转移性肾嫌色细胞*进行了系统的基因组研究,文中绘制基因流览图对整个基因组数据进行了可视化。转移性肾嫌色细胞*的基因组景观和演...