以及OTUs水平的结构比较图4.微生物总群落和硫酸盐还原菌群落的OTUs的门的水平分类。外饼为微生物总群落,内饼为硫酸盐还原菌群落。图5.微生物总群落和硫酸盐还原菌的α-多样性(a)与β-多样性(b)的对比2.按照epicPCR**初创始文章的方法,筛选出了120个高丰度的SRP-OTU(至少一个样本中为1%),并对其构建了进化树以观察进化分化(图6)。这些高丰度的SRP-OTU与17个描述的门相关,其中只有7个广为认可的SRP门。类似于微生物总群落的大多数OTUs,大多数SRP-OTUs只存在于某个特定的湖泊中,证明了在西藏盐湖中微生物群落和SRP亚群落的分布的地方特殊性。图。加黑字...
对于没有无法获得PCR产物的样品DNA,可通过DNA纯化或调整模板用量的方法予以解决(王光华等,2011)。此外,为减低土壤腐殖酸等干扰物对PCR扩增的干扰,每50μl体系可添加μlBSA来提高PCR扩增效率。3.关于PCR产物。引物MZIA1Bis和MZIA6是简并引物,专一性不强。环境中g23基因被扩增出来的同时,一些非g23基因的其它DN**段也可能被扩增出来。剔除这些非g23基因的方法,可采用看是否可以翻译成氨基酸序列,以及氨基酸序列通过GenBank上的BLASTp比对看是否是T4型细菌病毒g23家族的基因来解决。4.关于扩增的g23基因片段大小。g23是编码T4型细菌病毒头...