原 核 生物的ｒＲＮＡ 有３类：５ＳｒＲＮＡ、１６ＳｒＲＮＡ 和２３ＳｒＲＮＡ，其 编 码基因（ｒＤＮＡ）长度依次为１２０、１５４０及３３００个 核 苷 酸。它 们位于同一操纵子序列中，但被一些间隔区域所分开，从５′～ ３′端 依 次 是：１６Ｓ、间 隔 区、ｔＲＮＡ、间 隔 区、２３Ｓ、间 隔 区 和 ５Ｓ ｒＲＮＡ［２］，一个操纵子进行转录后处理成为成熟的１６Ｓ、２３Ｓ和 ５ＳｒＲＮＡ。ｒＲＮＡ 结构既具保守性又具高变性，保守性反 映 生 物物种的亲缘关系，高变性则揭示生物物种的特征核酸序列， 是属种鉴定的分子基础。因此，可以利用保守区设计通用...

在过去的十几年中，下一代测序(NGS)技术被 用于探索各种生态系统中微生物群落的多样 性和组成结构，对研究海洋、土壤、宿主等环境中 的微生物构成有重要的指导作用，同时也是系统发 育和分类学研究中一种使用的方法，特别是应 用于不同的环境宏基因组学样本中。随着高通量 测序技术的不断发展和参考数据库的不断更新，利 用核糖体操纵子作为 DNA 标记可以揭示不同生态 系统中的微生物多样性和组成。采用第二代高通量 测序平台测定的16S/18S/ITS某个高变区域的序列， 可以反映环境样品在细菌、、古菌等分类方面 物种之间的差异。然而，针...

rRNA 结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系, 高变性则揭示生物物种的特征核酸序列, 是属种鉴定的分子基础。 16S rRNA 基因大小适中, 约 1.5Kb 左右, 含有高 度保守的基因片段, 同时在不同的菌株间也含有 变异的核酸片段。因其既能体现不同菌属之间的 差异, 又能利用测序技术快速得到核酸序列, 已成 为理想的基因鉴定靶序列。通过对其序列的分析, 可以判定不同菌属、菌种间遗传关系的远近。细菌 的 16S rRNA 可变区位点结构如下: 可变区序列 因不同细菌而异, 恒定区序列基本保守, 所以可以 利用恒定区序列设计引物将 16S rRN**段扩增 出来, 利用...

在过去的十几年中，下一代测序(NGS)技术被用于探索各种生态系统中微生物群落的多样性和组成结构，对研究海洋、土壤、宿主等环境中的微生物构成有重要的指导作用，同时也是系统发育和分类学研究中一种使用的方法，特别是应用于不同的环境宏基因组学样本中随着高通量测序技术的不断发展和参考数据库的不断更新，利用核糖体操纵子作为 DNA 标记可以揭示不同生态系统中的微生物多样性和组成。采用第二代高通量测序平台测定的16S/18S/ITS某个高变区域的序列，可以反映环境样品在细菌、、古菌等分类方面物种之间的差异。然而，针对不同的环境样本，引物的选择和实验过程仍然需要更细致的验证。 ...

１６ＳｒＲＮＡ 基因序列分析的基本方法 通过１６ＳｒＲＮＡ 种属特异性的探针与 ＰＣＲ 产 物 杂 交 以 获 得微生物组成信息，或利用基因芯片将 ＤＮＡ 片段制作成探针 固定在支持物上，与 荧 光 标 记 的 待 检 ＤＮＡ 片 段 杂 交，通 过 观 察荧光信号的位置，即可确定待检细菌的种类。杨祖钦等，根 据引起化脓性脑膜炎的常见致病菌，成 功 地 建 立 了 ＤＮＡ 芯 片，可对该疾病快速、准确的诊断，明确病原菌。 对扩增产物进行变性 梯度凝胶电泳、温度梯度凝胶电泳（ＴＧＧＥ）分 析，直 接 观 察 其 多样性。Ｇｏｌｄｅｎｂｅｒｇ等［１１］...

微生物种群鉴定测序(16S/18S/ITS)为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，对18SrDNA某个高变区进行测序，用于研究环境微生物中真核微生物的群落多样性。ITS测序：ITS分为两个区域ITS1h和ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或ITS2进行测序，用于研究环境微生物中群落结构多样性Chemicalbook。微生物种群鉴定测序（16S18SITS）方法是首先提取样品中微生物总DNA，然后运用PCR技术扩增细菌基因组中的16SrDNA、基因组中的18SrDNA或ITS区域，获得绝大部分...