原 核 生物的ｒＲＮＡ 有３类：５ＳｒＲＮＡ、１６ＳｒＲＮＡ 和２３ＳｒＲＮＡ，其 编
码基因（ｒＤＮＡ）长度依次为１２０、１５４０及３３００个 核 苷 酸。它
们位于同一操纵子序列中，但被一些间隔区域所分开，从５′～
３′端 依 次 是：１６Ｓ、间 隔 区、ｔＲＮＡ、间 隔 区、２３Ｓ、间 隔 区 和 ５Ｓ
ｒＲＮＡ［２］，一个操纵子进行转录后处理成为成熟的１６Ｓ、２３Ｓ和
５ＳｒＲＮＡ。ｒＲＮＡ 结构既具保守性又具高变性，保守性反 映 生
物物种的亲缘关系，高变性则揭示生物物种的特征核酸序列，
是属种鉴定的分子基础。因此，可以利用保守区设计通用引
物扩增细菌的相应靶序列，再利用可变区的差异鉴别菌种。其
中以１６ＳｒＲＮＡ 基因及１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区在细菌鉴定
中的应用较为成熟。 上海融享生物科技有限公司主做ITS 的测序。河南细菌16S测序服务
2004 年, HS Kwon 等通过对 16S- 23S rRNA 进行套式 PCR 的方法, 对多株乳杆菌进行了快速 鉴定。2004 年, S Altun 等利用 16S rRNA 序列分 析对分离自虹鳟鱼中的格氏乳球菌( Lactococcus garvieae) 进行了鉴定。2004 年, X Bonjoch 等利用 套式 PCR 法分析 16S rRNA 序列, 对粪便中污染 的双歧杆菌的来源进行了鉴定。由于 16SrRNA 序列的保守性和存在的普遍 性, 以及核酸序列本身的稳定性、序列分析的重现 性极高, 基于当今分析技术的改进, 应用 16S rRNA 作为分子指标, 可以实现快速、微量、准确 简便的对微生物进行分类鉴定。分子分类正是在 从研究的目的过渡到研究的手段。随着分子分类 的理论和方法的日趋成熟, 其已逐步成为微生物 资源调查和整理的一种强有力工具。河南细菌16S测序服务上海融享生物科技有限公司就带您了解一下16s的特点。
扩增子测序是一种高靶向性地分析特定基因
组区域中基因变异的方法，是发现单核苷酸多态性
(single nucleotide polymorphisms，SNPs)的理想方
法。其利用 PCR 的引物来扩增基因组的特定区域，
靶向地捕获目标区域的 DNA，达到目的 DN**段
的富集目标；针对扩增产物(也被称为扩增子)
进行高通量测序，分析序列中的遗传变异等信息。
一般认为，核糖体 RNA (rRNA)基因存在于所
有细胞生物体中，由于很少发生大规模的横向基因
迁移，因此具有一系列由非常保守到高变的区域，
适合于微生物分类信息的确定。由于核糖体操纵子
具有足够的保守性，因此常被用作多样性调查的标
记基因，主要包括 16S rRNA、18S rRNA 和转录
间隔区(internal transcribed spacer，ITS)等。
ITS1 或 ITS2 究竟哪
个片段能更好地反映群落组成仍存有争议。
ITS1 通常比 ITS2 短，对物种分辨率低一些，但是
扩增和测序错误也低一些；ITS2 分辨率高，但是测
序的误差会增加 OTU 的数量。研究表明，在不同
的生态环境和群落复杂性下，ITS1 和 ITS2 测序结
果反映的群落组成既存在一致性，也存在差异性。
例如，在部分土壤和外生菌根群落研究中，
ITS1 和 ITS2 呈现出了相似的结果；而在部分土壤
和人类肠道群落研究，ITS1 和 ITS2 的结果则
存在差异。我们的结果表明，针对 ITS2 片段的
扩增引物覆盖度均高于针对 ITS1 片段的扩增引物。
总之，这些结果表明，群落结构研究所关注的
标记基因片段和引物选择尚未标准化。 16s 18S ITS 多种测序供您选择。
１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区序列分析的基本方法 通 用
引物的选取是 ＰＣＲ扩 增１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区鉴定细菌
的关键所在，在１６ＳｒＲＮＡ 上 至 少 有４个 保 守 区 域，区 域２存
在于真细 菌、古 细 菌 和 真 核 生 物 中，被认为是保守序列。
Ｇｕｒｔｌｅｒ等对１８个属２１个种的２３ＳｒＲＮＡ 的前５２０个碱基
进行研究后发现５个保守区域，其中区域１０保守，适合作
通用 引 物 设 计。因此从理论上而言，１６ＳｒＲＮＡ 的 区 域 ２ 和
２３ＳｒＲＮＡ 的区域１０是扩增１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区间的理想引物
设计部位。对于 ＰＣＲ扩增后的产物，Ｇｏｎｚａｌｅｚ等总结的主
要方法有依赖序列长度大小的电泳分离技术、特异序列杂交技
术、实时定量 ＰＣＲ技术、ＲＦＬＰ、ＤＮＡ 序列测定技术、焦磷酸测
序技术、单链构象多态性分析技术（ＳＳＣＰ）、质 谱 技 术（ＭＳ）和
高压液相色谱技术（ＨＰＬＣ） 上海融享生物科技有限公司主营测序包括ITS 。河南细菌16S测序服务
上海融享生物科技有限公司主营测序很多，其中 18S 销很好。河南细菌16S测序服务
rRNA 结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系, 高变性则揭示生物物种的特征核酸序列, 是属种鉴定的分子基础。 16S rRNA 基因大小适中, 约 1.5Kb 左右, 含有高 度保守的基因片段, 同时在不同的菌株间也含有 变异的核酸片段。因其既能体现不同菌属之间的 差异, 又能利用测序技术快速得到核酸序列, 已成 为理想的基因鉴定靶序列。通过对其序列的分析, 可以判定不同菌属、菌种间遗传关系的远近。细菌 的 16S rRNA 可变区位点结构如下: 可变区序列 因不同细菌而异, 恒定区序列基本保守, 所以可以 利用恒定区序列设计引物将 16S rRN**段扩增 出来, 利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种 的细菌进行分类鉴定。但较其它方法而言, 16S rRNA 序列测定分析更适用于确定属及属以上分 类单位的亲缘关系。河南细菌16S测序服务